CLASIFICACION DEL ADN

Se clasifican por sus cadenas monocatenaria o bicatenaria

COMPOSICION DEL ADN

Mostramos las estructuras que conforman el ADN

ENZIMAS

Las enzimas son catalizadoras

FORMACION DEL ADN

En la imagen se puede observar los procesos de formacion del ADN

sábado, 9 de julio de 2016

FORMACION DEL ADN

La replicación del ADN, que ocurre una sola vez en cada generación celular, necesita de muchos "ladrillos", enzimas, y una gran cantidad de energía en forma de ATP (recuerde que luego de la fase S del ciclo celular las células pasan a una fase G a fin de, entre otras cosas, recuperar energía para la siguiente fase de la división celular). La replicación del ADN en el ser humano a una velocidad de 50 nucleótidos por segundo, en procariotas a 500/segundo. Los nucleótidos tienen que se armados y estar disponibles en el núcleo conjuntamente con la energía para unirlos.

La iniciación de la replicación siempre acontece en un cierto grupo de nucleótidos, el origen de la replicación, requiere entre otras de las enzimas helicasas para romper los puentes hidrógeno y las topoisomerasas para aliviar la tensión y de las proteínas de unión a cadena simple para mantener separadas las cadenas abiertas.



Una vez que se abre la molécula, se forma una área conocida como "burbuja de replicación" en ella se encuentran las "horquillas de replicación" . Por acción de la la ADN polimerasa los nuevos nucleótidos entran en la horquilla y se enlazan con el nucleótido correspondiente de la cadena de origen (A con T, C con G). Los procariotas abren una sola burbuja de replicación, mientras que los eucariotas múltiples. El ADN se replica en toda su longitud por confluencia de las "burbujas".

Dado que las cadenas del ADN son antiparalelas, y que la replicación procede solo en la dirección 5' to 3' en ambas cadenas, numerosos experimentos mostraron que, una cadena formará una copia continua, mientras que en la otra se formarán una serie de fragmentos cortos conocidos como fragmentos de Okazaki . La cadena que se sintetiza de manera continua se conoce como cadena adelantada y, la que se sintetiza en fragmentos, cadena atrasada.

Para que trabaje la ADN polimerasa es necesario la presencia, en el inicio de cada nuevo fragmento, de pequeñas unidades de ARN conocidas como cebadores, a posteriori, cuando la polimerasa toca el extremo 5' de un cebador, se activan otras enzimas, que remueven los fragmentos de ARN, colocan nucleótidos de ADN en su lugar y, una ADN ligasa los une a la cadena en crecimiento.



ESTRUCTURA DEL ADN

Cada molécula de ADN está constituida por dos cadenas o bandas formadas por un elevado número de compuestos químicos llamados nucleótidos. Estas cadenas forman una especie de escalera retorcida que se llama doble hélice. Cada nucleótido está formado por tres unidades: una molécula de azúcar llamada desoxirribosa, un grupo fosfato y uno de cuatro posibles compuestos nitrogenados llamados bases: adenina (abreviada como A), guanina (G), timina (T) y citosina (C).La siguiente figura ilustra las tres unidades,en el dibujo que esta a la izquierda,la bolita roja es oxigeno,la violeta es fosforo,la verde es carbono,la blanca es hidrogeno y la azul es nitrógeno.


La molécula de desoxirribosa ocupa el centro del nucleótido y está flanqueada por un grupo fosfato a un lado y una base al otro. El grupo fosfato está a su vez unido a la desoxirribosa del nucleótido adyacente de la cadena,en el siguiente dibujo se ilustra la union del grupo fosfato y la desoxirribosa,en esta ultima los atomos de carbono no fueron escritos para simplificar el dibujo,


Estas subunidades enlazadas desoxirribosa-fosfato forman los lados de la escalera; las bases están enfrentadas por parejas, mirando hacia el interior y forman los travesaños.
Los nucleótidos de cada una de las dos cadenas que forman el ADN establecen una asociación específica con los correspondientes de la otra cadena. Debido a la afinidad química entre las bases, los nucleótidos que contienen adenina se acoplan siempre con los que contienen timina, y los que contienen citosina con los que contienen guanina. Las bases complementarias se unen entre sí por enlaces químicos débiles llamados puentes de hidrógeno.El siguiente esquema muestra lo descripto en forma muy ilustrativa,el enlace debil,puente de hidrogeno se lo representa en lineas punteadas,

ADN Y SU CLASIFICACION

¿Qué es el ADN?
ADN significa ácido desoxirribonucleico. El ADN es la molécula que lleva la información genética utilizada por una célula para la creación de proteínas. El ADN contiene las instrucciones genéticas usadas en el desarrollo y funcionamiento de todos los organismos vivos conocidos. La función principal de las moléculas de ADN es el almacenamiento a largo plazo de la información genética. ADN es a menudo comparado con un conjunto de planos para los seres humanos.


ADN: clasificación

Su clasificación varía según los especialistas concentrados en el tema. Generalmente se suele tener en cuenta la estructura y particularidades que contiene cada tipo de ADN, para así determinar la mejor manera de agruparlos. A continuación se expone una de las clasificaciones mas completas:

-ADN cromosómico

Es el ADN de la célula, en el mismo se almacena la información genética perteneciente de la misma. Su ubicación depende de la célula en cuestión, en el caso de las eucariotas se encuentra dentro del núcleo celular y en las procariontes, en el citoplasma asociado a la cara interna de la membrana celular.

Se trata de una doble cadena de bases complementarias formada cada una por nucleótido, cada uno de ellos formados por una base de pirmidina o purina, azúcar desoxirribosa y un grupo fosfato. El genoma humano esta constituido por 23 moléculas de ADN con una longitud de entre 50 y 250 millones de bases.

-ADN recombinante o recombinado

Se trata de una unión de secuencias de ADN producida de manera artificial generalmente de forma in vitro. Estas cadenas provienen de dos organismos de especies diferentes que no tienen ninguna relación.

Esta técnica es utilizada para manipular el material genético, lo que permite que sea añadido un nuevo tipo de ADN al organismo, esto genera modificación en los rasgos o la creación de nuevos. Este procedimiento es llevado a cabo con diferentes fines, como por ejemplo para tratar algún tipo de enfermedad o la producción de vacunas. Para esto se busca un organismo que tenga un ADN de interés y luego se propaga el mismo en otro organismo, objeto, etc. Esto es muy utilizado como tratamiento de fertilidad.

-ADN mitocondrial

Este tipo de ADN se refiere al material genético existente en orgánulos de la célula llamados mitocondrias, los cuales son los encargados de proveer energía a dicha célula. Este ADN se reproduce por si mismo cuando la célula eucariota se divide. Se cree que evolutivamente este tipo de ADN desciende del genoma de las bacterias, las cuales fueron englobadas en s células eucariotas.

-ADN fósil

Se utiliza en el área de paleontología, generalmente para determinar la antigüedad de ADN en cuestión, para esto se utiliza una reacción en cadena de polimerasas lo que permite estudiar los registros a nivel molecular del ADN encontrado para determinar la vejez del mismo. Con este tipo de procedimiento se dedujo que ADN del fósil más antiguo encontrado pertenece a neandertales de no más de 50.000 años.

-ADN superenrollado

Esta molécula tiene como característica principal que esta, como su nombre lo indica, enrollada o girada sobre si misma. Esto fue descubierto gracias a los diversos estudios topológicos de la molécula de ADN. Se reconoce que una secuencia de ADN puede estar en diferentes estados de relajación, es decir planos, o de manera contraria en varios estados de enrollamiento. El superenrollamiento se da como consecuencia de una tensión que sufre la molécula en su estructura y puede aparecer de forma tanto negativa como positiva. Esto esta regulado por las enzimas toposomerasas.



domingo, 26 de junio de 2016

CLASIFICACION DE LAS ENZIMAS

CLASIFICACION DE LAS ENZIMAS




FACTORES QUE AFECTAN LA VELOCIDAD DE UNA REACCIÓN CATALIZADA POR ENZIMAS

• Concentración de sustrato o sustratos (cofactores)

• Concentración de enzima

• Inhibidores

• Activadores

• pH

• Temperatura
Regulación de la actividad enzimática por unión a la enzima de ligandos que no son sustrato

• INHIBIDOR : Molécula o ion que al unirse a la enzima produce una disminución en la velocidad de la reacción catalizada.

• ACTIVADOR: Molécula o ion que al unirse a la enzima produce un aumento en la velocidad de la reacción catalizada.

TIPOS DE INHIBIDORES

ISOSTÉRICO El inhibidor se une al mismo sitio que el sustrato (sitio activo).

ALOSTÉRICO El inhibidor se une a un sitio diferente al que se une el sustrato (sitio alostérico).
TIPOS DE INHIBIDORES

COMPETITIVO – El inhibidor se une a la enzima libre interfiriendo con la unión del sustrato.

INCOMPETITIVO – El inhibidor se une al complejo enzima-sustrato interfiriendo con la formación de producto.

NO COMPETITIVO – Es un tipo especial de inhibidor mixto que se une con igual afinidad a la enzima libre y al complejo enzima-sustrato.

ESTRUCTURA DE LAS ENZIMAS








¿QUE SON?

Los enzimas son biomoléculas especializadas en la catálisis de las reacciones químicas que tienen lugar en la célula. Son muy eficaces como catalizadores ya que son capaces de aumentar la velocidad de las reacciones químicas mucho más que cualquier catalizador artificial conocido, y además son altamente específicos ya que cada uno de ellos induce la transformación de un sólo tipo de sustancia y no de otras que se puedan encontrar en el medio de reacción.

¿SON LAS ENZIMAS PROTEINAS?

Existen numerosas razones para afirmar que las enzimas son proteínas. La más importantes son las siguientes:

•El análisis de las enzimas obtenidas en forma más pura, criatalizada, demuestra que son proteínas.

•Las enzimas son inactivadas a altas temperaturas y, en general, la cinética de la desnaturalización térmica de las enzimas da resultados muy parecidos a los de la desnaturalización térmica de las proteínas; por ejemplo el Q10 de la mayoría de las reacciones químicas es de 2 a 3, y, en el caso de las enzimas, a temperaturas elevadas, alrededor de 60 a 70 ° C, la actividad neta aumenta varios cientos, como sucede con la velocidad de la desnaturalización térmica de las proteínas.

•Las enzimas son activadas en una zona muy restringida de pH, y presenta un punto óptimo de ph donde su actividad es mayor. Las proteínas en su punto isoeléctrico, muestran propiedades parecidas desde el punto de vista de viscosidad, solubilidad, difusión, etc., que resulta del todo similares a las propiedades de este tipo que muestran las enzimas.

•Todos los agentes que desnaturalizan a las proteínas también destruyen o inactivan a las enzimas, ya sea el calor, los ácidos fuertes, o los metales pesados que pueden combinarse con ellas.

•Los problemas de solubilidad y de precipitación son comunes a las proteínas y las enzimas; en general, son solubles en agua o soluciones salinas, insolubles en alcohol, precipitan con determinadas concentraciones de sales neutras, etc.


NOMENCLATURA DE LA ENZIMA


NOMBRE RECOMENDADO

Antiguamente, los enzimas recibían nombres particulares, asignados por su descubridor. Al ir aumentando el número de enzimas conocidos, se hizo necesaria una nomenclatura sistemática que informara sobre la acción específica de cada enzima y los sustratos sobre los que actuaba.

NOMBRE SISTEMÁTICO

El nombre sistemático de un enzima consta actualmente de 3 partes:
• el sustrato preferente
• el tipo de reacción realizado
• terminación "asa"
Un ejemplo sería la glucosa fosfato isomerasa que cataliza la isomerización de la glucosa-6-fosfato en fructosa-6-fosfato.
Muchos enzimas catalizan reacciones reversibles. No hay una manera única para fijar cual de los dos sentidos se utiliza para nombrar al enzima. Así, la glucosa fosfato isomerasa también podría llamarse fructosa fosfato isomerasa.
Cuando la acción típica del enzima es la hidrólisis del sustrato, el segundo componente del nombre se omite y por ejemplo, la lactosa hidrolasa se llama simplemente lactasa. Además de los nombre sistemáticos, aún persisten otros consagrados por el uso. Así, la glucosa: ATP fosforiltransferasa se llama habitualmente glucoquinasa.

NOMENCLATURA DE LA COMISIÓN ENZIMÁTICA

El nombre de cada enzima puede ser identificado por un código numérico, encabezado por las letras EC (enzyme commission), seguidas de cuatro números separados por puntos. El primer número indica a cual de las seis clases pertenece el enzima, el segundo se refiere a distintas subclases dentro de cada grupo, el tercero y el cuarto se refieren a los grupos químicos específicos que intervienen en la reacción. (Este enlace te lleva a la página de la Enzyme Comission, donde puedes acceder a todas las clases y subclases de enzimas).
Así, la ATP:glucosa fosfotransferasa (glucoquinasa) se define como EC 2.7.1.2. El número 2 indica que es una transferasa, el 7 que es una fosfotransferasa, el 1 indica que el aceptor es un grupo OH, y el último 2 indica que es un OH de la D-glucosa el que acepta el grupo fosfato.